HA基因遗传进化分析和分支更新。如下图所示,通过对666条代表性的H9N2 HA基因进行遗传进化分析,并以0.2的遗传距离为阈值进行分支划分,发现2012年4月出现了一个新的分支,我们将其命名为Clade 16。对此前报道的流行分支Clade 15和新分支Clade 16在2010-2020年的占比情况进行逐年统计,发现2013年以后,Clade 15和Clade 16共同流行,且Clade 16逐渐取代Clade 15成为新的流行分支。
参考文献:
Xiyue Wang, Kaituo Liu et al. “Emergence of a new designated clade 16 with significant antigenic drift in hemagglutinin gene of H9N2 subtype avian influenza virus in eastern China.” Emerging Microbes & Infections DOI: 10.1080/22221751.2023.2249558